Phylogenetischer Atlas

Zehn Cluster, 239 Herkünfte.

Eine visuelle Karte der zehn genetischen Cluster des Kakaos und der Herkünfte in diesem Archiv, die jedes davon tragen. Topologie nach Motamayor et al. 2008, PLoS ONE 3(10):e3311 (genetic clusters). Der Baum dient der visuellen Orientierung; Clusterzuordnungen folgen dem Statusfeld jeder Herkunft — draft / reviewed / verified.

Mit der Maus über Herkünfte fahren, um das Cluster hervorzuheben; klicken zum Öffnen.

Drei biogeografische Gruppierungen werden hervorgehoben: ein Kerngebiet im oberen Amazonas, in dem die meiste Diversität liegt, eine Ausbreitung im unteren Amazonas und über den Atlantik mit Amelonado im Zentrum sowie das mesoamerikanische Relikt, vertreten durch Criollo.

Oberer Amazonas — Kerngebiet der Diversität

Contamana · Curaray · Iquitos · Marañón · Nanay · Purús

Unterer Amazonas / transatlantische Ausbreitung

Amelonado · Guiana · Nacional

Mesoamerikanisches Relikt

Criollo

Die ursprüngliche Phylogenie leitet sich aus 106 Mikrosatellitenmarkern ab, die an rund 1.200 Kakaoproben aus dem oberen Amazonas und Mesoamerika genotypisiert wurden. Der Zehn-Cluster-Rahmen auf dieser Seite folgt jener Arbeit; eine zusätzliche Markeranalyse wird hier nicht durchgeführt. Astlängen sind illustrativ — nur die Topologie ist aussagekräftig.

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