系統アトラス
Ten clusters, 239 origins.
カカオの10遺伝クラスターと、それぞれを担う本アーカイブの原産地を視覚的に示した地図です。トポロジーはMotamayor et al. 2008, PLoS ONE 3(10):e3311 (genetic clusters)に基づきます。系統樹は視覚参照用であり、クラスターの割り当ては各原産地のステータスフィールド — draft / reviewed / verified — に従います。
原産地にホバーするとクラスターがハイライトされ、クリックで開きます。
上部アマゾン — 中核的多様性中心
Contamana · Curaray · Iquitos · Marañón · Nanay · Purús
下部アマゾン / 大西洋越えの広がり
Amelonado · Guiana · Nacional
メソアメリカ遺存集団
Criollo
元の系統樹は、上部アマゾンおよびメソアメリカ由来の約1,200のカカオサンプルにわたって遺伝子型決定された106のマイクロサテライトマーカーに由来します。このページの10クラスター枠組みはその論文に従い、ここでは追加のマーカー解析は行いません。枝の長さは説明的なものであり、トポロジーのみが情報を持ちます。