Atlas filogenético
Diez grupos, 124 orígenes.
Un mapa visual de los diez grupos genéticos del cacao y los orígenes de este archivo que portan cada uno. Topología según Motamayor et al. 2008, PLoS ONE 3(10):e3311 (genetic clusters). El árbol se presenta como referencia visual; las asignaciones de grupo siguen el campo de estado de cada origen — borrador / revisado / verificado.
Amazonia alta — núcleo de diversidad
Contamana · Curaray · Iquitos · Marañón · Nanay · Purús
Amazonia baja / expansión trasatlántica
Amelonado · Guiana · Nacional
Relicto mesoamericano
Criollo
La filogenia original procede de 106 marcadores microsatélite genotipados en aproximadamente 1.200 muestras de cacao de la Amazonia alta y Mesoamérica. El marco de diez grupos de esta página sigue ese trabajo; aquí no se realiza ningún análisis adicional de marcadores. Las longitudes de las ramas son ilustrativas — solo la topología es informativa.