20世紀の大半を通じて、カカオ（Theobroma cacao）は単純な三分法のモデルで記述されていた。すなわち、クリオロ、フォラステロ、トリニタリオである。クリオロは初期メソアメリカ栽培の珍しくマイルドで芳香的なカカオを、フォラステロは世界の収穫の大半を支える丈夫で多収のアマゾンカカオを、トリニタリオはその両者の交雑種を表していた。このモデルは教えやすく、今なお広く繰り返されているが、過度の単純化である。

主な問題は、「フォラステロ」が決して真の生物学的な群ではなかったことである。それはクリオロでないすべてのものを指す総称的なラベルであり、この種の実際の多様性の大半を覆い隠していた。アマゾン盆地の野生・半野生カカオは単一のカテゴリーで表現できるよりもはるかに多様であり、それを一つの型として扱うことが、その変異を見えなくした。

Motamayor et al.（2008）はこれに直接取り組んだ。広範なカカオ遺伝資源のコレクションにわたって分子マーカーを用い、彼らはこの種を10の遺伝子クラスターに再分類した。すなわち、Criollo、Amelonado、Contamana、Curaray、Guiana、Iquitos、Marañón、Nacional、Nanay、Purúsである。これらのクラスターの大半は、この種の多様性の中心であるアッパーアマゾンの諸地域に対応する。この枠組みではクリオロは引き続き一つのクラスターであり、アメロナド（歴史的に西アフリカに広まった低多様性の下流アマゾン集団）は別の一つであり、かつて「フォラステロ」だったものの大半は残りのアマゾンの群に分布している。

この再構成はまた、しばしば誤解される二つの名前を明確にする。トリニタリオはまったく遺伝子クラスターではない。それはクリオロとアマゾンのカカオの交配に由来し、最初にトリニダードで生じた交雑集団の一群であり、均一ではなく遺伝的に変異に富んでいる。CCN-51も同様に、単一の育種されたクローンであり、収量と耐病性のためにエクアドルで選抜された交雑種であって、クラスターでも伝統的な型でもない。「ナシオナル」はMotamayorの分類における真のクラスターである。すなわち、歴史的にエクアドルで栽培された花のようなarribaカカオと結びついた、西アマゾンの群である。

現代のアーカイブは三分法のモデルではなくクラスターの枠組みを用いるべきである。なぜなら、それはカカオの多様性の実際の構造を反映し、集団を交雑種やクローンと区別し、産地を記述するための安定した証拠に基づく語彙を与えるからである。より古い用語が禁じられているわけではない。それらは有用な略称であり続け、取引では絶えず登場するが、遺伝的なカテゴリーではなく、歴史的・商業的なカテゴリーとして理解されるべきである。

これは初期段階のアーカイブにおける参考資料である。訂正を歓迎する。