На протяжении большей части двадцатого века какао (Theobroma cacao) описывали с помощью простой трёхчастной модели: Criollo, Forastero и Trinitario. Criollo обозначал редкое, мягкое, ароматическое какао раннего мезоамериканского возделывания; Forastero — выносливое, высокоурожайное амазонское какао, стоящее за большей частью мирового урожая; а Trinitario — гибриды между двумя первыми. Модель было легко преподавать, и её по-прежнему широко повторяют, но это упрощение.

Главная проблема в том, что «Forastero» никогда не был настоящей биологической группой. Это был обобщающий ярлык для всего, что не являлось Criollo, и он скрывал большую часть фактического разнообразия вида. Дикое и полудикое какао бассейна Амазонки гораздо разнообразнее, чем может выразить одна категория, и обращение с ним как с единым типом делало это разнообразие невидимым.

Motamayor et al. (2008) обратились к этому напрямую. Используя молекулярные маркеры по широкой коллекции зародышевой плазмы какао, они переклассифицировали вид на десять генетических кластеров: Criollo, Amelonado, Contamana, Curaray, Guiana, Iquitos, Marañón, Nacional, Nanay и Purús. Большинство этих кластеров соответствуют регионам верхней Амазонии — центру разнообразия вида. В этой системе Criollo остаётся одним кластером, Amelonado (маловариабельная нижнеамазонская популяция, исторически распространённая в Западную Африку) — другим, а основная масса того, что некогда было «Forastero», распределена по остальным амазонским группам.

Эта перестройка также проясняет два названия, которые часто понимают неверно. Trinitario вовсе не является генетическим кластером. Это семейство гибридных популяций, происходящих от скрещиваний между Criollo и амазонским какао, впервые возникших на Тринидаде, и оно генетически изменчиво, а не однородно. CCN-51, подобным образом, — это единственный выведенный клон — гибрид, отобранный в Эквадоре за урожайность и устойчивость к болезням, — а не кластер и не традиционный тип. «Nacional» действительно является кластером в системе Motamayor: западноамазонская группа, связанная с цветочным какао arriba, исторически выращиваемым в Эквадоре.

Современный архив должен использовать кластерную систему, а не трёхчастную модель, потому что она отражает фактическую структуру разнообразия какао, отличает популяции от гибридов и клонов и даёт устойчивый, основанный на доказательствах словарь для описания происхождений. Более старые термины не запрещены — они остаются полезным сокращением и постоянно встречаются в торговле, — но их следует понимать как исторические и коммерческие категории, а не генетические.

Это справочный материал в архиве на ранней стадии; исправления приветствуются.