在二十世纪的大部分时间里，可可（Theobroma cacao）是用一个简单的三分模型来描述的：克里奥罗、Forastero和特立尼达里奥。克里奥罗代表早期中美洲种植中那种稀有、温和、芳香的可可；Forastero代表支撑世界大部分作物的耐寒、高产的亚马逊可可；特立尼达里奥则代表二者之间的杂交种。这一模型易于教授，至今仍被广泛沿用，但它是一种过度简化。

主要问题在于，“Forastero”从来就不是一个真正的生物学群组。它是一个用来概括所有非克里奥罗事物的笼统标签，掩盖了该物种实际多样性的大部分。亚马逊流域的野生和半野生可可远比单一类别所能表达的更为多样，把它当作一个类型来对待，使那种变异变得不可见。

Motamayor等人（2008）直接处理了这一问题。他们利用跨越广泛可可种质收藏的分子标记，把该物种重新分类为十个遗传聚类：Criollo、Amelonado、Contamana、Curaray、Guiana、Iquitos、Marañón、Nacional、Nanay和Purús。这些聚类中的大多数对应着上亚马逊的各个地区，那里是该物种多样性的中心。在这一框架中，克里奥罗仍是一个聚类，Amelonado（历史上传播到西非的低多样性下亚马逊种群）是另一个，而曾经的“Forastero”的大部分则分布在其余的亚马逊群组之中。

这种重新框定还澄清了两个常被误解的名称。特立尼达里奥根本不是一个遗传聚类。它是一个由克里奥罗与亚马逊可可杂交衍生而来、最初产生于特立尼达岛的杂交种群家族，它在遗传上是多变的而非统一的。同样，CCN-51是一个单一的选育无性系——一个在厄瓜多尔为产量和耐病性而选出的杂交无性系——既不是聚类，也不是传统类型。“Nacional”在Motamayor的方案中确实是一个聚类：即与历史上在厄瓜多尔种植的花香arriba可可相关联的西亚马逊群组。

现代档案应当使用聚类框架而非三分模型，因为它反映了可可多样性的实际结构，把种群与杂交种和无性系区分开来，并为描述产区提供了一套稳定、基于证据的词汇。较旧的术语并未被禁用——它们作为简便的说法仍然有用，并在贸易中不断出现——但应当把它们理解为历史和商业的类别，而非遗传的类别。

这是一个早期阶段档案中的参考材料；欢迎指正。